tilibit公司PRO-S-3-8●Scaffold ssDNA 8064bp介紹

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一、產品描述

品牌：tilibit  

貨號：PRO-S-3-8  

品名：單鏈DNA骨架（Scaffold ssDNA）8064bp  

規格：50 pmol  

tilibit Scaffold ssDNA 8064bp 是專為DNA折紙技術（DNA Origami）設計的高純度單鏈DNA骨架，由德國tilibit公司基于M13噬菌體基因組優化合成。該產品通過精密的化學合成技術確保序列準確性，錯誤率低于行業標準（<0.1%），適用于構建復雜納米結構，如分子馬達、藥物遞送載體及生物傳感器。其8064個堿基的長度提供足夠的靈活性和穩定性，支持動態關節設計和化學功能化修飾（如熒光染料、氨基基團等），滿足科研與工業場景的多樣化需求。  

關鍵參數：  

• 序列類型：M13mp18衍生單鏈DNA  

• 長度：8064 bp  

• 濃度：100 nM（溶于TE緩沖液）  

• 包裝規格：50 pmol/管  

• 適用場景：標準DNA折紙折疊反應（25次）、定制納米器件開發  

二、產品特點

1. 高精度合成  

   采用合成工藝，確保序列一致性，減少堿基錯配和缺失，適用于對精度要求很高的實驗（如納米電子器件組裝）。  

2. 低能耗折疊  

   通過優化的單鏈骨架設計，顯著降低DNA折紙反應的能耗，縮短折疊時間至1-2小時。  

3. 功能化兼容性  

   支持化學修飾（如氨基、巰基、熒光標記），便于后續功能化開發（如靶向藥物遞送、細胞標記）。  

4. 長期穩定性  

   -20℃避光保存條件下，可維持DNA結構完整性超過12個月，避免降解或聚集。  

5. 應用廣泛性  

   覆蓋分子生物學、材料科學、醫療診斷等領域，支持從基礎研究到工業生產的跨學科應用。  

三、儲存條件

• 溫度：-20℃避光保存，避免反復凍融。  

• 濕度：相對濕度<30%，建議使用干燥劑輔助密封。  

• 保質期：自生產日起24個月（未開封）。  

• 注意事項：若需短期使用（<1周），可暫存于4℃冷藏，但需避免污染。  

四、工作原理

tilibit Scaffold ssDNA 8064bp 基于DNA折紙技術，通過互補堿基配對自組裝成預設的二維或三維納米結構。其核心機制包括：  

1. 支架鏈引導：單鏈DNA作為骨架，通過設計好的切口與互補的短鏈（staple strands）結合，形成特定折疊路徑。  

2. 動態調控：通過引入柔性連接序列或化學修飾位點，實現結構在外部信號（如pH、溫度）下的動態響應。  

3. 功能集成：利用化學修飾位點引入熒光探針或靶向分子，賦予納米結構檢測或治療功能。  

五、解決實驗中哪些問題

1. 復雜結構構建難題  

   傳統DNA自組裝技術難以實現大尺寸（>5000 bp）結構的精準折疊，本產品通過優化的骨架設計顯著提升成功率。  

2. 實驗重復性差  

   高純度單鏈DNA減少雜質干擾，確保每次折疊反應的一致性，降低實驗失敗率。  

3. 功能化限制  

   支持多修飾位點設計，解決傳統DNA納米材料功能單一的問題，適用于靶向藥物遞送和分子識別。  

4. 成本高昂  

   通過規模化生產工藝降低成本，50 pmol規格可滿足25次標準實驗需求，性價比優于同類產品。  

六、使用方法

1. 實驗前準備  

• 試劑準備：需搭配tilibit折疊緩沖液（貨號K1-5-0）及短鏈DNA（staple strands）。  

• 設備要求：恒溫金屬浴（推薦溫度精度±0.1℃）、熒光顯微鏡（若需實時監測）。  

2. 標準折疊流程  

• 步驟1：將50 pmol Scaffold ssDNA溶于10 μL TE緩沖液（pH 8.0）。  

• 步驟2：加入預熱的折疊緩沖液（40 μL，含Mg2?濃度10 mM），混勻后95℃加熱5分鐘。  

• 步驟3：梯度降溫至25℃（每分鐘降1℃），靜置1小時完成折疊。  

• 步驟4：通過瓊脂糖凝膠電泳驗證產物（推薦使用tilibit配套凝膠染料）。  

3. 功能化修飾示例  

• 熒光標記：在折疊前將FITC標記的短鏈與支架鏈混合，實現結構可視化。  

• 靶向修飾：通過氨基基團偶聯抗體或藥物分子，用于細胞特異性遞送。  

七、常見問題與解決方案

問題1：折疊后電泳條帶模糊  

• 可能原因：短鏈DNA比例失調或鎂離子濃度不足。  

• 解決方案：優化staple strands濃度（建議10:1），補充MgCl?至終濃度15 mM。  

問題2：熒光信號弱  

• 可能原因：修飾位點被封閉或探針結合效率低。  

• 解決方案：增加修飾反應時間至2小時，或使用更高效的熒光染料（如Cy5）。  

問題3：結構穩定性差  

• 可能原因：儲存溫度波動或反復凍融導致DNA降解。  

• 解決方案：分裝保存，避免反復解凍；使用RNase-free試劑。  

問題4：折疊效率低  

• 可能原因：緩沖液pH值偏離或溫度控制不精確。  

• 解決方案：使用預熱的折疊緩沖液（95℃±1℃），并確保恒溫設備校準。  

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