firebirdbio自回避分子識(shí)別系統(tǒng)

firebirdbio自回避分子識(shí)別系統(tǒng)（SAMRS 

核酸擴(kuò)增反應(yīng)遭受脫靶擴(kuò)增產(chǎn)物的形成。該問題隨著反應(yīng)中引物的數(shù)量而增加，并且主要由于引物-引物相互作用而發(fā)生。因此，從引物堿基中選擇性除去氫鍵合單元會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生自我逃避的DNA引物，可以添加這些引物以實(shí)現(xiàn)和改善多重PCR。

如下所示，帶*的SAMRS堿基可以與標(biāo)準(zhǔn)堿基（在靶標(biāo)或擴(kuò)增子中）成對(duì)，但不能與其他SAMRS堿基成對(duì)。

 自回避分子識(shí)別系統(tǒng)-SAMRS ^TM
亞磷酰胺和寡核苷酸

含有SAMRS的寡核苷酸：

將SAMRS堿基放入PCR和其他擴(kuò)增技術(shù)所用引物中的一般規(guī)則。大寫字母表示標(biāo)準(zhǔn)基數(shù)，小寫字母表示SAMRS基數(shù)。 

• 建議長(zhǎng)度為20-35 nts。SAMRS堿基應(yīng)在寡核苷酸3'末端的前4至5個(gè)位置使用，而不是在前面的3'堿基中使用。
• 每個(gè)寡核苷酸應(yīng)使用兩個(gè)至四個(gè)SAMRS堿基，優(yōu)選兩個(gè)或三個(gè)SAMRS修飾。
• SAMRS t堿基在引物二聚體的形成方面沒有顯示出太多的減少，因此在選擇時(shí)好用a，g或c代替t。
• 避免在由三個(gè)和四個(gè)連續(xù)相同的堿基組成的字符串中使用SAMRS堿基。例如：應(yīng)避免使用ggg，ccc，aaa，ttt，gggg，cccc，aaa和tttt。
• SAMRS堿基與標(biāo)準(zhǔn)堿基分開，例如：gGg，cCc，aaAA和tTt。
• 如果寡核苷酸的3'末端為標(biāo)準(zhǔn)A或T，則第二個(gè)堿基也應(yīng)為標(biāo)準(zhǔn)堿基，然后進(jìn)行兩個(gè)或三個(gè)SAMRS修飾。

Firebird還準(zhǔn)備SAMRS寡核苷酸文庫(kù)。

SAMRS可以在寡核苷酸中與AEGIS結(jié)合使用，以實(shí)現(xiàn)高度復(fù)用和高度清潔的PCR和等溫?cái)U(kuò)增。請(qǐng)咨詢。

與所有引物設(shè)計(jì)一樣，F(xiàn)irebird無(wú)法保證遵循這些規(guī)則制成的寡核苷酸的性能。

Benner等人，2015；Glushakova et al。，2015a，2015b; Hoshika et al。，2010; Sharma等，2014；Yang等人，2015年和未發(fā)布的數(shù)據(jù)