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    arcticzymes尿嘧啶-DNA糖基化酶

    更新時間:2019-05-15      點擊次數:2195

    arcticzymes尿嘧啶-DNA糖基化酶

    Cod Uracil-DNA Glycosylase

    鱈魚尿嘧啶-DNA糖基化酶

    來自Atlantic Cod的Cod Uracil-DNA糖基化酶(Cod UNG)是僅有可商購的UNG酶,其通過適度熱處理*且不可逆地滅活。該酶在含有修飾的Cod UNG基因的重組大腸桿菌(ung-)菌株中產生。

    Cod UNG酶的主要優點

    • 熱不穩定
    • 在55°C時*不可逆地滅活
    • 使用Cod UNG可在RT-PCR中實現污染控制
    • PCR后不會降解PCR產物。這使得PCR產物的下游使用成為可能
    • 高純度酶,無污染核酸酶測試

     

    Product information

    Article no.

    Notes

    Price

    Cod UNG – Pack size: 100 U quantity

    Pack size: 100 UConc.: 1U/µl

    #70500-201

    €92

    Cod UNG Triton FREE – Pack size: 100 U quantity

    Triton FREE
    Pack size: 100 UConc.: 1U/µl

    #70501-201

    €92

    Cod UNG – Pack size: 1000 U quantity

    Pack size: 1000 UConc.: 1U/µl

    #70500-202

    €390

    Cod UNG Triton FREE – Pack size: 1000 U quantity

    Triton FREE
    Pack size: 1000 UConc.: 1U/µl

    #70501-202

    €390

    N/A

    Pack size: 50 kUConc.: 50U/µl

    #70500-150

    REQUEST QUOTE

    N/A

    Pack size: 50 kUConc.: 1U/µl

    #70500-151

    REQUEST QUOTE

    N/A

    Glycerol-free
    Pack size: 5000 UConc.: 50U/µl

    #70510-105

    REQUEST QUOTE

    N/A

    Glycerol-free
    Pack size: 50 kUConc.: 50U/µl

    #70510-150

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    N/A

    Pack size: 200 kUConc.: 50U/µl

    #70500-160

    REQUEST QUOTE

     

    PCR攜帶預防

    關于PCR預防的一般信息

    PCR的高靈敏度,特別是qPCR,使得該方法易于污染,產生錯誤或不準確的結果。來自先前PCR的攜帶污染物被認為是假陽性結果的主要來源之一。由于氣溶膠,污染移液管,表面,手套和試劑,污染物可能從先前的擴增反應中帶走。

    在PCR之前切割含有尿嘧啶的DNA

    在擴增DNA和RNA時,有兩種常見的策略可以防止污染物。一個是設置一個單獨的實驗室進行設置和放大,大限度地減少移液步驟的數量,并防止擴增后管子打開。然而,由于實際原因,這并不總是可行的。此外,它無法保證避免污染。

    防止污染的另一種常見的策略是在PCR擴增期間用dUTP部分或*替代dTTP,從而產生含有尿嘧啶的DNA。在開始PCR之前,用尿嘧啶-DNA糖基化酶(UNG)處理PCR混合物。在初的變性步驟期間,溫度升高至95℃,導致脫嘧啶位點的裂解和攜帶DNA的片段化。由于模板含有胸苷,因此不受UNG處理的影響。所有PCR都是用dUTP替代dTTP進行的先決條件。

    使用我們的Cod UNG的好處是它在55?C時不可逆轉地滅活。Cod UNG是僅有兼容一步式RT-qPCR的UNG!

     

    RT-qPCR中的PCR預防

    Cod UNG是僅有兼容一步式RT-qPCR的UNG

    在逆轉錄酶qPCR(RT-qPCR)中,RNA是初始模板。然而,污染物的問題在這里可能與常規PCR一樣多。逆轉錄后,cDNA是PCR的模板。如果您的樣品被先前PCR的PCR產物污染,則引物無法區分cDNA和DNA,從而導致錯誤結果。

    在一步法RT-qPCR試劑盒中,將RNA加入含有逆轉錄酶和聚合酶的主混合物中,使cDNA合成和qPCR在同一試管中。 大腸桿菌 UNG / UDG的宜工作溫度可達約。50?C并且通常保持其活性達到約。70℃。該溫度范圍與一步法RT-qPCR方案中的殘留預防不相容,因為  大腸桿菌  UNG / UDG將在逆轉錄期間去除摻入cDNA中的尿嘧啶,從而導致模板降解。

    來自ArcticZymes的重組表達的Cod UNG初是從冷適應生物大西洋鱈魚中分離的。Cod UNG在20?C至40?C的溫度范圍內具有高活性,在溫度高于42?C時會迅速失去活性,并且在55?C時已經不可逆轉地失活。由于Cod UNG的宜溫度范圍與大腸桿菌相比要低得多  UNG / UDG,Cod UNG兼容單管RT-qPCR。通過添加Cod UNG至終濃度0.01U /μl簡單地進行殘留預防,并在開始RT-qPCR之前在25℃引入5分鐘的孵育步驟。或者,可以將濃度增加至0.04U /μl并省略預孵育步驟。Cod UNG將有效去除樣品設置和循環儀升溫過程中的殘留污染。

    在這里,我們顯示Cod UNG可用于在含有dUTP而非dTTP的商業一步法RT-qPCR主混合物中進行殘留物預防。用Cod UNG處理不影響靶cDNA,產生與未處理樣品相同的Cq值。為了比較,用通用UNG處理導致顯著的Cq延遲,證明與一步RT-qPCR不相容。

    Cod UNG與一步式RT-qPCR兼容
    圖1. Cod UNG與一步法RT-qPCR中的通用UNG相比較。進行一步RT-qPCR,將Cod UNG和通用UNG與未處理的對照進行比較。用Cod UNG處理不影響靶cDNA,產生與未處理樣品相同的Cq值。用通用UNG處理導致顯著的Cq延遲,證明與一步RT-qPCR不相容。
    Cod UNG有效去除殘留的擴增子
    圖2. Cod UNG有效去除DNA。在進行一步RT-qPCR之前,將含有尿嘧啶的DNA的加標引入RNA樣品中。沒有引入預孵育步驟。用Cod UNG治療成功地將加標的擴增子移除至檢測限以下。

     

     

    熱敏型尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)是來源于嗜冷海洋細菌經大腸桿菌表達純化的的重組蛋白,又稱南極熱敏UDG。該熱敏UDG酶能有效地水解單鏈或雙鏈 DNA 上的尿嘧啶,產生的缺嘧啶位點,在高溫或高 pH 下,極易水解斷裂。該酶對RNA無活性,主要用于PCR擴增產物的防污染。大腸桿菌來源的尿嘧啶-DNA 糖基化酶較為耐熱,經95℃10min處理仍會殘留有少量的尿嘧啶-DNA 糖基化酶活性,導致含有dU堿基的PCR產物的降解。而來源于嗜冷海洋細菌的熱敏UDG在50℃ 5min即*失活,在進行PCR擴增前,在PCR混合液中添加尿嘧啶-DNA 糖基化酶(熱敏性),25℃10min即可消除PCR產物的殘留污染,由于尿嘧啶-DNA 糖基化酶(熱敏性)在PCR循環的94℃變性一步便可被滅活,因此不會影響新的含dU的PCR產物。

     

    應用

    • 去除單鏈或雙鏈DNA中的尿嘧啶堿基
    • 去除 PCR 殘存污染

    活性定義

    在標準反應體系下,37°C每分鐘催化 60 pmol 尿嘧啶從含尿嘧啶的雙鏈 DNA 上釋放所需要的酶量為一個活性單位。

    反應buffer

    Heatlabile Uracil DNA Glycosylase (UDG)與絕大多數的PCR 聚合酶反應緩沖液都是兼容的,但在高離子濃度(>100mM)下活性會受到抑制。

    酶保存液

    20 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM DTT, , 50% Glycerol, 0.1% (w/v) Triton X-100, pH 7.5。

    儲存

    -20℃可保存2年,避免反復凍融。

    熱失活

    50℃,10min。

     

     

     

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